Segundo Vieira (2004), a área estimada de plantio de C. citriodora no Brasil era de 85 mil ha, com maior concentração nos estados de Minas Gerais e São Paulo (Kronka et al., 2002), sendo cultivada principalmente por pequenos e médios proprietários rurais (Vieira, 2004).
Conforme Reis et al. (2013), há certo grau de dificuldade na produção de mudas de C. citriodora, pois, em geral, apresentam lento crescimento, o que reduz a capacidade de reter nutrientes da adubação de cobertura devido a rápida lixiviação. Além disso, há chances de maior susceptibilidade às doenças e exigências nutricionais (Bernardi et al., 2012). Mudas de C. citriodora são produzidas apenas pelo sistema de semeadura, pois não há bons resultados no enraizamento para sistema de estaquia (EMBRAPA, 2003).
Povoamentos de C. citriodora podem ser manejados exclusivamente para produção de madeira devido à sua boa qualidade; mas também para obtenção de óleo essencial.
O manejo voltado para a produção de madeira apenas é comumente realizado no sistema de alto fuste, em espaçamentos que variam de 3x1,5 m, 3x3 m, e principalmente 3x2 m (1666 plantas/ha) (Vieira, 2004). O estudo de Oliveira et al. (1999) investigou a produtividade e características do fuste para 39 progênies de C. citriodora em plantios com 16 anos de idade e espaçamento de 3x2 m, no município de Anhembi-SP. Eles observaram um incremento médio anual (IMA) de madeira na ordem de 38m³/ha.ano e descreveram o formato dos fustes como regulares e pouco sinuosos e com um fator de forma médio de 0,49.
Por outro lado, em plantios de C. citriodora voltados para a produção de óleo essencial, espaçamentos menores têm sido adotados, por exemplo: 1x1 m, 1,5x1,5 m, 2x1 m e 3x1 m (Vieira, 2004; Silva et al., 2009). O sistema de manejo mais utilizado é o de talhadia, em que após o corte raso da floresta, faz-se a condução das brotações (Galanti, 1987). Esse método garante maior taxa de crescimento inicial das plantas, pelo fato das cepas já terem um sistema radicular desenvolvido quando comparado ao plantio de novas mudas (reforma) (Reis e Reis, 1997). Segundo Vieira (2004), a coleta de folhas na primeira rotação pode ser realizada a partir de 1 ano de idade da floresta, fazendo-se a desrama dos 2/3 inferiores da copa, repetindo-se a atividade a cada 1 ano até que a árvore atinja uma altura que inviabilize a desrama. Então faz-se o corte raso para coleta de 100% das folhas e aproveitamento da madeira (geralmente, para lenha), e dá-se início a segunda rotação, com a condução das brotas. Quanto ao manejo das brotações, a primeira desbrota acontece por volta de 8 meses, quando é realizada a primeira coleta de folhas, deixando dois brotos por touça até a idade de 2 anos. Nesse período é realizado um segundo desbaste, deixando apenas um fuste por árvore. Com esse método o cultivo se torna mais produtivo, pois aproveita o máximo das brotações ocupando o mesmo espaço e sistema radicular. 
Após certo número de rotações (geralmente duas ou três, podendo ser mais), torna-se necessário realizar a reforma da área, devido à queda de produção causada por fatores como mortalidade de árvores, mortalidade de cepas, esgotamento de nutrientes, compactação do solo e decréscimo do vigor das cepas (Reis e Reis, 1997). A reforma da área pode ser também justificada quando se deseja adotar um material genético mais produtivo disponível no mercado. Por exemplo, trabalhos de melhoramento já conseguiram elevar a produtividade de óleo de C citriodora em até 1%, significando cerca de 10 kg de óleo a mais a cada tonelada de folha destilada (Donalísio, 1986).
 Silva et al. (2009) estudaram o efeito do espaçamento de plantio e intensidade do manejo sobre a produção de biomassa de folhas e de óleo essencial em plantios de C. citriodora. O primeiro tratamento possuía densidade de 1666 plantas/ha (3x2 m), com coleta de folhas dos 2/3 inferiores da copa a cada 12 meses; enquanto que o tratamento alternativo possuía densidade de 10 mil plantas/ha (1x1 m) com coleta de folhas a cada 6 meses por meio de corte raso das plantas e posterior condução das brotas. Após 30 meses de idade o manejo adensado havia produzido 3 vezes mais óleo essencial (363 L/ha versus 116 L/ha). Apesar de maior produção, o plantio adensado com manejo intensivo também possui desvantagens, como maior custo de implantação, maior exportação de nutrientes, e a não produção de madeira ao final da rotação/ciclo.
O principal componente do óleo de C. citriodora é o citronelal (65 a 80%), sendo ele obtido por destilação com arraste por vapor d`água, com uma recuperação média de até 2% base peso verde das folhas (Vitti e Brito, 2003).

Segundo Vieira (2004), o C. citriodora é considerado uma das espécies mais atacadas por insetos. Os maiores danos são causados por insetos pertencentes às ordens Hymenopteras (formigas cortadeiras), Lepidopteras (lagartas) e Coleopteras (besouro de folhas) (Berti Filho, 1984).
Reis et al. (2013) apontam que o C. citriodora é uma das espécies mais suscetíveis à deficiência de boro entre os eucaliptos, podendo estar relacionada à suscetibilidade ao ataque de patógenos secundários, como os fungos Botryosphaeria ribis e Lasiodiplodia theobromae (Silveira et al., 1996; 1998; 2001).